เกรตซอลท์เลคมีแม่น้ำสายหลัก 3 สายและลำธารย่อยหลายสายไหลผ่าน แม่น้ำสายหลักสามสายแต่ละสายถูกป้อนโดยตรงหรือโดยอ้อมจากเทือกเขา Uinta ทางตะวันออกเฉียงเหนือของยูทาห์ แม่น้ำแบร์เริ่มต้นที่เนินทางเหนือของ Uintas และไหลไปทางเหนือผ่านทะเลสาบแบร์ซึ่งน้ำในแม่น้ำแบร์บางส่วนถูกผัน ผ่านคลองที่มนุษย์สร้างขึ้นลงสู่ทะเลสาบ แต่ต่อมาก็ไหลกลับลงสู่แม่น้ำโดยใช้วิธี ของ Bear Lake Outlet จากนั้นแม่น้ำจะหันไปทางใต้ในไอดาโฮตอนใต้และไหลลงสู่แขนตะวันออกเฉียงเหนือของเกรตซอลท์เลคในที่สุด แม่น้ำเวเบอร์ยังเริ่มต้นที่ทางลาดด้านเหนือของเทือกเขา Uinta และไหลลงสู่ขอบด้านตะวันออกของ ทะเลสาบน้ำเค็ม แม่น้ำจอร์แดนไม่ได้รับน้ำโดยตรงจาก Uintas; ค่อนข้างจะไหลมาจากน้ำจืดในทะเลสาบยูทาห์ซึ่งส่วนใหญ่มาจากแม่น้ำโพรโว แม่น้ำ Provo มีต้นกำเนิดใน Uintas ห่างจาก Weber and Bear ไม่กี่ไมล์ แม่น้ำจอร์แดนไหลจากทางตอนเหนือของทะเลสาบยูทาห์ไปยังมุมตะวันออกเฉียงใต้ของเกรตซอลท์เลค เนื่องจากความตื้นเขินของทะเลสาบ ระดับน้ำสามารถลดลงและเพิ่มขึ้นอย่างมากในช่วงปีที่แห้งแล้งหรือปีที่มีฝนตกชุก ซึ่งสะท้อนถึงช่วงแล้งหรือเปียกชื้นเป็นเวลานาน การเปลี่ยนแปลงของระดับน้ำในทะเลสาบถูกปรับอย่างมากโดยมหาสมุทรแปซิฟิกผ่านการไหลเวียนของบรรยากาศที่ผันผวนที่ความถี่ต่ำ นักวิทยาศาสตร์สามารถทำนายความผันผวนของระดับน้ำในทะเลสาบเป็นเวลา 5-8 ปีได้ Utah Climate Center จัดทำคำทำนายระดับทะเลสาบประจำปีของ Great Salt Lake การคาดการณ์นี้ใช้อุณหภูมิของมหาสมุทรแปซิฟิกเขตร้อนตอนกลาง ปริมาณน้ำฝนที่ลุ่มน้ำ ข้อมูลวงแหวนต้นไม้ที่มีอายุมากกว่า 750 ปีและระดับของทะเลสาบเอง